בטמפרטורת החדר, פנטאריתריטול מופיע בדרך כלל כאבקה גבישית לבנה; הוא יציב מאוד ואינו עובר בקלות שינויים כימיים משמעותיים בתנאים רגילים. יש לאחסן אותו במחסן יבש, קריר ומאוורר- היטב, הרחק מחשיפה ממושכת לטמפרטורות גבוהות ולאור שמש ישיר. מכיוון שפנטאריתריטול הוא מעט היגרוסקופי, סביבת האחסון לא צריכה להיות לחה מדי; יש לצמצם מגע עם לחות אטמוספרית כדי למנוע התגבשות הנגרמת על ידי רטיבות, שעלולה להשפיע על השימוש הבא.
יש להשתמש באריזות בעלות תכונות אטימה טובות במהלך האחסון, ולשמור על שלמות האריזה. עבור מוצרים בשקיות, יש לבחור חומרי אריזה עמידים-לרטיבות; אם האריזה פגומה, יש להחליף אותה או לאטום אותה מיד. יש לסווג קבוצות שונות ולסומן בבירור, ואין לאחסן את המוצר לצד כימיקלים שאינם תואמים. יש לשמור על ניקיון המחסן כדי למנוע מאבק או זיהומים לזהם את המוצר ולפגוע בטוהר שלו.
פנטאריתריטול מועבר בדרך כלל בשקיות, תופים או אריזה אחרת המתאימה לאבקות מוצקות, כאשר השיטה הספציפית נקבעת לפי מפרטי המוצר ומרחק ההובלה. יש לנקוט זהירות במהלך הטעינה והפריקה כדי למנוע פגיעה באריזה או גרימת שחרור מוגזם של אבק. רכבי הובלה או מכולות חייבים להיות יבשים, נקיים ועמידים בפני גשם; יש להימנע מחשיפה למים או לאור שמש ממושך בטמפרטורה- גבוהה במהלך המעבר. עבור הובלה- למרחקים ארוכים, יש לבדוק את אטמי האריזה כדי למנוע ספיגת לחות או זיהום.
במהלך האחסון וההובלה, תיוג מוצרים, ניהול{0}}רישום אצווה וניהול מלאי חייבים לעמוד בתקנות ניהול כימיקלים. למרות שהפנטאריתריטול יציב בתנאים רגילים, יש להימנע ממגע עם חומרים שאינם תואמים-כגון חומרי חמצון חזקים-. הפעולות צריכות לציית לגיליון נתוני הבטיחות (SDS) של המוצר הספציפי ולהנחיות האחסון וההובלה של הספק, תוך ציות לתקנות המקומיות כדי להבטיח איכות ובטיחות המוצר לאורך כל התהליך.